domingo, 25 de noviembre de 2018

BACTERIOLOGÍA

PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS PARA LA DETECCIÓN DE ESCHERICHIA COLI

E.coli es una bacteria mas constantemente encontrada en la materia fecal del hombre y de muchas especies animales. su nicho ecológico natural es el intestino delgado y el intestino grueso, forma parte de la flora nativa intestinal y se encuentra en calidad de saprobio sin causar daño. Por el contrario, muchas cepas de E. coli producen sustancias que son útiles al hospedero como son las colicinas, que tienen un efecto inhibitorio sobre otras cepas potencialmente patógenas, por lo que la colonización del intestino es benéfica para el hospedero.

Es la especie predominante de la flora anaerobica facultativa del colon humano. las infecciones producidas por cepas de E. coli patógenas pueden estar limitadas a mucosas o bien diseminarse.

Cuatro síndromes clínicos pueden resultar de la infección por cepas patógenas:
  • Infección de las vías urinarias
  • Sepsis
  • Meningitis
  • Enfermedad diarreica
CARACTERÍSTICAS DE E.coli

  • Bacilo gram negativo
  • Móvil
  • No exigente
  • Fermenta glucosa y lactosa con producción de gas
  • Tienen información genética en los plásmidos que son responsables en la producción de toxinas y resistencia a los antimicrobianos
  • Aerobio y Anerobio facultativo con flagelos perítricos
  • La mayoría forma fimbrias o pilis
  •  Muchas cepas producen una pequeña microcápsula y muy pocas elaboran macrocápsula y no fabrican esporas.

CARACTERÍSTICAS DE LAS COLONIAS

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AGAR EMB: colonias grandes con centros de color oscuroe incluso rojo y tienen un brillo verde metálico cuando se observa con luz reflejada.

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AGAR MAC CONKEY: colonias de color rosadas o rojas con halos turbios



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AGAR SANGRE: Colonias medianas blanquecinas redondas, algunas cepas pueden producir hemólisis

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AGAR XLD: colonias de color beige o amarillo circulares, conversión amarilla del medio por las colonias productoras de ácido



PRUEBAS BIOQUÍMICAS PARA LA IDENTIFICACIÓN E.coli

KLIGER: AMARILLO/ AMARILLO CON PRODUCCIÓN DE GAS

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ROJO DE METILO: POSITIVO

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VOGES-PROSKAUER: NEGATIVO

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INDOL: POSITIVO

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CITRATO: NEGATIVO ( COLOR VERDE)

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CATALASA: POSITIVO

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OXIDASA: NEGATIVO

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UREASA: NEGATIVO ( COLOR AMARILLO)

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MOTILIDAD: POSITIVO
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LISINA: POSITIVO

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FENILALANINA: NEGATIVO

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GENETICA

GENÓMICA DEL SÍNDROME DE DOWN



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El síndrome de Down es la alteración cromosómica más frecuente y la causa principal de discapacidad intelectual leve o moderado en todo el mundo. En la mayoría de los casos su causa es una copia extra del cromosoma 21 (47,XX,+21 o 47,XY,+21).  El cariotipo normal de una mujer es 46,XX y el de un hombre es 46, XY

 Abarca un conjunto complejo de patologías que involucran prácticamente todos los órganos y sistemas. Las alteraciones más prevalentes y distintivas son la dificultad para el aprendizaje, dismorfias craneofaciales, hipotiroidismo, cardiopatías congénitas, alteraciones gastrointestinales y leucemias.


El síndrome de Down se debe a una trisomía completa Hsa21 o una trisomía parcial que incluye la región crítica 21q22.3. El 95% de los casos se debe a una trisomía completa o regular; alrededor de 3% se debe a mosaicismo, una alteración en la que los pacientes tienen conjuntamente células normales y células con un Hsa21 extra; menos de 2% se origina por una traslocación no equilibrada; es decir, un cariotipo con 46 cromosomas, pero uno de ellos, usualmente el cromosoma 14, contiene material cromosómico extra del Hsa21.


INCIDENCIA
La incidencia global del síndrome de Down se aproxima a uno de cada 700 nacimientos pero se ha observado que en casos de edad materna avanzada el riesgo es mucho mayor.
De hecho, en mujeres de 37 años se ha estimado que 1 de cada 200 niños nacidos es portador de Síndrome de Down y este valor aumenta a medida que avanza la edad materna.

ASPECTOS GENÉTICOS
La principal causa de trisomía 21 son errores en la meiosis de los ovocitos. En casos de edad materna avanzada y debido a un envejecimiento de la reserva ovárica, se produce un mayor riesgo de que los ovocitos realicen la meiosis de forma incorrecta, haciendo mal el reparto de los cromosomas a las células hijas y dando lugar a embriones  con más o menos cromosomas.
Otra posible causa de trisomía 21 son ciertas alteraciones del cariotipo (anomalías cromosómicas) que pueden producir la formación de espermatozoides/óvulos portadores de alteraciones cromosómicas

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ASPECTOS CLÍNICOS
Dentro de los aspectos clínicos de la trisomÍa en el cromosoma 21 estan:

  • Exceso de piel en la nuca
  • Perfil plano
  • Pabellón auricular pequeño
  • Pliegue palmar único
  • Braquimesofalangia del quinto dedo
  • Desviación mongoloidea de la hendidura palpebral
  • Hipotonía
  • Reflejo de moro pobre
  • Hiperextensibilidad de las articulaciones
  • amplia separacion del primer y segundo dedo
  • Cabello y cejas finos
  • Protusión de la lengua 
  • Nariz corta
  • baja estatura
  • Ojos presentan manchas de Brushfield alrededor del margen del iris

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DIAGNÓSTICO
El diagnóstico del la trisomía 21 se hace tomando en cuenta las caracteristicas morfológicas y genéticas en el recién nacido,  Sin embargo, estas características pueden presentarse en bebés que no tienen síndrome de Down, por lo que se realiza un análisis cromosómico (cariotipo) para confirmar el diagnóstico. Para obtener un cariotipo, los médicos le sacan sangre al bebé y toman fotografías de los cromosomas. Las agrupan por tamaño, número y forma. El síndrome de Down se diagnostica mediante el estudio del cariotipo y la identificación de una copia total o parcial adicional del cromosoma 21.
 Una prueba genética similar llamada hibridación fluorescente in situ (FISH) también puede confirmar el diagnóstico. Hay dos tipos de pruebas para el síndrome de Down que se pueden realizar antes de que nazca un bebé: pruebas de detección y pruebas diagnósticas.
 Las pruebas de detección prenatales calculan la posibilidad de que el feto tenga el síndrome de Down. Las pruebas diagnósticas pueden proporcionar un diagnóstico definitivo con casi el 100% de precisión. La mayoría de las pruebas de detección se realizan mediante un examen de sangre y un ultrasonido (ecografía). Los exámenes de sangre (o pruebas de detección en suero) miden las cantidades de sustancias en la sangre de la madre. Junto con la edad de la madre, se utilizan las pruebas para calcular la probabilidad de tener un hijo con síndrome de Down. Las pruebas de detección en suero a menudo se realizan conjuntamente con una ecografía detallada para comprobar la presencia de marcadores (características que algunos investigadores estiman que pueden tener una asociación significativa con el síndrome de Down). Los investigadores han desarrollado una combinación de suero/ ecografía/edad de la madre que arroja datos más precisos en una etapa más temprana del embarazo. 
Las nuevas pruebas de detección prenatales no invasivas como MaterniT21 y Harmony se realizan mediante la extracción de sangre de la futura madre tan pronto como a las 10 semanas de gestación y se basan en la detección de ADN libre de células, que circula entre el feto y la madre. En la actualidad, se ofrecen pruebas de detección prenatales de forma habitual a mujeres de todas las edades. Si la detección prenatal determina que la probabilidad de tener un hijo con síndrome de Down es alta, los médicos suelen aconsejar que la madre se realice pruebas de diagnóstico si desea un diagnóstico definitivo. Los procedimientos de diagnóstico disponibles para el diagnóstico prenatal del síndrome de Down son la muestra de vellosidades coriónicas (CVS) y la amniocentesis. La CVS se realiza generalmente en el primer trimestre, entre las semanas 9 y 11, y la amniocentesis se realiza generalmente en el segundo trimestre después de 15 semanas de gestación. Estos procedimientos, que presentan un riesgo de hasta 1% de causar un aborto espontáneo, son prácticamente 100% precisos en el diagnóstico del síndrome de Down.

INMUNOLOGÍA



ENFERMEDAD DE TRANSMISIÓN SEXUAL: SIFILIS

La sífilis es una enfermedad infecciosa con afectación sistémica causada por el microorganismo Treponema pallidum subespecie pallidum, perteneciente al Orden Spirochaetales, familia Spirochaetaceae. Son organismos de diámetro exiguo, con morfología característicamente enrollada. Presentan un movimiento rotatorio y ondulado sobre el eje central de la bacteria. De los treponemas identificados, solo cuatro causan enfermedad en el ser humano: T. pallidum ssp pallidum (sífilis), T. pallidum ssp pertenue (frambesia o pian), T. pallidum ssp endemicum (bejel) y Treponema carateum (pinta). Estos cuatro microorganismos son parásitos obligados del hombre y no se conoce un reservorio animal. Estos treponemas son morfológica, serológica y químicamente indistinguibles, por lo que las pruebas diagnósticas de la sífilis pueden ser usadas para diagnosticar la frambesia, el bejel o la pinta. Las enfermedades se diferencian por las manifestaciones clínicas que producen, le edad de la población afectada, la distribución geográfica y el modo de transmisión. Muchas espiroquetas no pueden ser cultivadas in vitro, necesitando medios altamente enriquecidos y en un tiempo determinado. 


EPIDEMIOLOGÍA

 Se producen más de 5 millones de casos nuevos de sífilis en todo el mundo, y la mayoría de las infecciones ocurre en  los países de ingresos bajos y medios, donde la infección es endémica y las infecciones congénitas no son infrecuentes.
Los programas de cribado de la OMS han reducido los índices de sífilis materna e infantil en más de un tercio mientras que la sífilis congénita ha sido eliminada en al menos una nación (Cuba).
Por el contrario, en los países de ingresos más elevados, la infección es común y ocurre desproporcionadamente en personas de sectores marginales de la sociedad, como los que viven en la pobreza, con un acceso deficiente a la atención de la salud, o las minorías raciales, étnicas y sexuales.
En los países de altos ingreso, la sífilis se transmite principalmente dentro de estrechas redes sexuales y sociales, una característica que permite observar que aunque la enfermedad es relativamente poco frecuente, más del 15-20% de los casos de sífilis diagnosticados anualmente en EE. UU. fueron diagnosticados antes.
En contraste con la epidemia observada en EE.UU. durante la década de 1990, que en gran medida afectó a personas heterosexuales, en asociación con una epidemia concomitante del consumo de crack cocaína, el resurgimiento actual en Europa occidental y las Américas ha afectado en forma desproporcionada a los hombres que tienen sexo con hombres, y ha estado estrechamente vinculada a la infección por el VIH.
Este perfil de resurgimiento periódico de la sífilis ocurre en períodos de 10 a 15 años y ha sido atribuido a la falta de continuidad de las medidas de control, al cambio en las conductas de riesgo (como el consumo de cocaína crack) y, en a nivel de la población, al crecimiento y disminución de la Inmunidad parcial a la infección del huésped.
Poco después del reconocimiento de la epidemia del VIH, epidemiológicamente, la sífilis ha estado estrechamente asociada a la infección por el VIH. Las úlceras genitales sifilíticas están densamente infiltradas con linfocitos (las principales células objetivo de la infección por el VIH) y así proporcionan una puerta  de entrada para la adquisición del VIH y un foco para su transmisión (y la de la sífilis) a otros.
En EE. UU., en 2014, casi el 40% de las personas diagnosticadas con sífilis temprana estaban infectadas con el VIH en el momento del diagnóstico de sífilis y, en algunos lugares, el 3,5-4% de los que eran VIH negativos en el momento de la infección se infectaron con VIH en el año posterior al diagnóstico. La incidencia del VIH en la década posterior al diagnóstico de sífilis el diagnóstico de VIH fue de una incidencia del 20%.
Por otra parte, los investigadores han sugerido que en las personas con VIH, las manifestaciones de sífilis o la respuesta a la terapia recomendada podrían ser diferentes como resultado del efecto del VIH en la inmunidad del huésped. Sin embargo, analizadas más cuidadosamente, las diferencias no suelen ser estadísticamente significativas, reafirmando la variabilidad sustancial de las manifestaciones sifilíticas.
Por otra parte, después de diagnóstico de sífilis, los pacientes que reciben tratamiento para el VIH podrían ser más profundamente estudiados y seguidos con más regularidad, lo que podría introducir un sesgo que favorecería la variabilidad de la presentación de la sífilis y la respuesta a la terapia entre personas confectadas con el  VIH.
Aunque la sífilis es una enfermedad infecciosa crónica que puede causar morbilidad a lo largo de su historia natural, la infección es transmisible a otros (con excepción de la infección congénita), solo durante los primeros años de la infección, lo que ha llevado a que las medidas de control se centren en las etapas primaria, secundaria y latente temprana, algunas veces llamada sífilis infecciosa. Después de 2-3 años de infección no tratada, la transmisión es rara y la atención principal se enfoca en la morbilidad individual, incluida la neurosífilis tardía, la sífilis cardiovascular y las infecciones gomatosas.

MANIFESTACIONES CLÍNICAS

Sífilis primaria :El primer signo de la sífilis es una pequeña llaga, que se denomina «chancro». La llaga aparece en el lugar donde la bacteria ingresó al cuerpo. Si bien la mayoría de las personas infectadas por sífilis tienen solo un chancro, algunas personas presentan varios. El chancro suele aparecer alrededor de 3 semanas después de la exposición. Muchas de las personas que tienen sífilis no notan el chancro porque suele ser indoloro y puede estar oculto en la vagina o el recto. El chancro se curará solo en un período de entre 3 y 6 semanas.
Sífilis primaria

Sífilis secundariaLuego de unas pocas semanas después de que se cure el chancro, es posible que sientas una erupción cutánea que comienza en el tronco y, finalmente, cubre todo el cuerpo (incluso las palmas de las manos y las plantas de los pies). Esta erupción cutánea no suele producir picazón y puede estar acompañada por llagas que parecen verrugas en la boca y la zona genital. Algunas personas también padecen caída del cabello, dolores musculares, fiebre, dolor de garganta e hinchazón de los ganglios linfáticos. Estos signos y síntomas pueden desaparecer en pocas semanas o pueden aparecer y desaparecer de forma repetida durante hasta un año.
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Sífilis latente : Si no recibes tratamiento para la sífilis, la enfermedad pasa de la etapa secundaria a la etapa latente (oculta), en la cual no tienes síntomas. La etapa latente puede durar años. Es posible que los signos y síntomas no vuelvan a presentarse nunca, o bien la enfermedad puede progresar a la tercera etapa (etapa terciaria).
Sífilis terciaria (tardía) :Entre el 15 y el 30 por ciento de las personas infectadas por sífilis que no reciben tratamiento presentarán complicaciones conocidas como sífilis terciaria (tardía). En la etapa tardía, la enfermedad puede dañar el cerebro, nervios, ojos, corazón, vasos sanguíneos, hígados, huesos y articulaciones. Estos problemas pueden ocurrir muchos años después de la infección original que no se trató.

Sífilis congénita : Los bebés de las mujeres con sífilis pueden infectarse mediante la placenta o durante el parto. La mayoría de los recién nacidos con sífilis congénita no presentan síntomas, aunque en algunos casos se puede presentar una erupción cutánea en las palmas de las manos y las plantas de los pies. Los síntomas posteriores pueden comprender sordera, deformidades en los dientes y la nariz en silla de montar (cuando colapsa el puente nasal).


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Neurosífilis: En términos generales, la neurosífilis es una superposición de alteraciones meningovasculares parenquimatosas. El diagnóstico de la neurosífilis asintomática se realiza en pacientes que no tienen manifestaciones clínicas pero sí anormalidades del líquido cefalorraquídeo (LCR), como pleocitosis, aumento de las proteínas, disminución de la glucosa o una respuesta positiva en la prueba VDRL, con lo cual se hace necesario la punción lumbar para poder establecerlo. La neurosífilis meningovascular se debe al desarrollo de una endoarteritis obliterante que afecta a los vasos sanguíneos de las meninges, cerebro, cordones espinales, etc., que provocará múltiples infartos. La parenquimatosa se debe a la destrucción de las células nerviosas, sobre todo de la corteza cerebral. Las manifestaciones clínicas consisten en paresia, afasia, manifestaciones psiquiátricas, etc. Destacan la tabes dorsal y el signo de la pupila de Argyll-Robertson. En la tabes dorsal, el daño se produce principalmente por una desmielinización de la columna posterior, ganglios y raíces dorsales que provocará la aparición de un cuadro clínico de ataxia, parestesias, incontinencia fecal, impotencia, etc. Las alteraciones oculares son frecuentes, destacando el signo antes mencionado, que consiste en una pupila pequeña e irregular que acomoda para la visión de cerca, pero no ante estímulos luminosos. En un período de meses a años puede aparecer una atrofia óptica. Cualquier par craneal puede estar afectado, destacando el VII y el VIII. Oído y ojo pueden estarlo afectos en cualquier estadio de la enfermedad, incluso en la sífilis congénita. 

DIAGNÓSTICO DE LABORATORIO 

Detección directa de T. pallidum 
Examen en fresco con microscopía de campo oscuro. Es el método de diagnóstico más rápido y directo en las fases primaria, secundaria y congénita precoz. La muestra ideal es el exudado de las lesiones, como el chancro, condiloma plano y lesiones mucosas, ya que contienen gran cantidad de treponemas; también pueden observarse a partir del material aspirado de los ganglios linfáticos. La muestra debe ser lavada con suero salino sin aditivos bactericidas. El treponema aparecerá moviéndose en espiral con una ondulación característica sobre su punto medio. Es importante señalar que, en las lesiones bucales o anales es difícil diferenciar T. pallidum de otros treponemas no patógenos, por lo que la técnica de campo oscuro no es aplicable. Para excluir el diagnóstico se requieren tres exámenes negativos.
 Inmunofluorescencia directa (DFA-TP). Consiste en la tinción con anticuerpos monoclonales o policlonales fluorescentes dirigidos frente a T. pallidum en los frotis desecados de lesiones sospechosas, una vez fijados con acetona o metanol. Esta técnica es obligada para el examen de las lesiones orales, por las razones antes señaladas. Demostración en tejidos. Requiere materiales obtenidos por biopsia, sobre los que se lleva a cabo una impregnación argéntica, o bien una tinción inmunofluorescente (DFAT-TP) o inmunoenzimática específica. La DFAT-TP utiliza un anticuerpo monoclonal muy específico de T. pallidum. Se suele utilizar para muestras cutáneas de sífilis secundaria o estadios sifilíticos tardíos (goma), así como en los tejidos afectados de cerebro, placenta, cordón umbilical o piel en la sífilis congénita. 
Cultivo de T. pallidum. El único método útil para aislar T. pallidum es la prueba de inoculación en el conejo (RIT). Esta técnica se considera como de referencia para el resto de las pruebas diagnósticas de la sífilis. Por su dificultad y peligrosidad sólo se realiza en laboratorios de referencia muy específicos y de investigación. Técnicas de biología molecular. Los métodos de amplificación de ácidos nucleicos aumentan la sensibilidad de los métodos de detección de T. pallidum, siendo útiles en los casos en que el resto de pruebas muestran una baja sensibilidad, como es el caso del diagnóstico de la sífilis congénita, neurosífilis, en la sífilis primaria temprana y cuando existe la necesidad de distinguir entre una reinfección y una infección antigua.

Detección indirecta de T. pallidum: 
pruebas serológicas Se detectan dos tipos de anticuerpos: los llamados reagínicos, no específicos o no treponémicos, y los treponémicos o específicos (IgG e IgM). Pruebas reagínicas o no treponémicas. Los anticuerpos reagínicos son de tipo IgG e IgM dirigidos frente a un antígeno lipoideo que es el resultado de la interacción de T. pallidum con los tejidos del huésped (cardiolipina-colesterol-lecitina). Aunque los resultados falsos positivos son bastante frecuentes, son los mejores métodos de diagnóstico serológico en la sífilis latente temprana y en la tardía. Las pruebas reagínicas se dividen en: 
● Floculación microscópica: VDRL (Venereal Disease Research Laboratory), USR. 
● Floculación macroscópica: RPR prueba en tarjeta de reaginas plasmáticas rápidas, ART, TRUST, RST. 
● Enzimoinmunoensayo (ELISA) no trepónemico: utiliza como antígeno el del VDRL. El VDRL es una prueba no treponémica normalizada en la cual el suero, previamente inactivado a 56 ºC, se enfrenta en un portaobjetos con un antígeno de cardiolipina-colesterol-lecitina para observar su capacidad de floculación. Tanto el RPR como el VDRL son buenos marcadores de la infección en su fase aguda y útiles en el control de la respuesta al tratamiento en el paciente con inmunidad intacta, aunque son poco específicos. El RPR ha pasado a ser la prueba de cribado habitual para la selección de sueros en los laboratorios y en los bancos de sangre, puesto que se trata de una técnica más sencilla, requiere menor cantidad de suero y no hace falta calentarlo. El VDRL es la prueba de elección para el diagnóstico de la neurosífilis en muestras de LCR. La mayor utilidad del ELISA es el cribado de poblaciones, por la gran cantidad de muestras que puede procesar al mismo tiempo. Como contrapartida negativa, no permite obtener resultados cuantitativos. 

TRATAMIENTO 

La eficacia del tratamiento es bien conocida. Sin embargo, para que sea adecuado hay que tener en cuenta una serie de recomendaciones obtenidas de las infecciones experimentales: a) que T. pallidum se regenerará al cabo de 18-24 h si los niveles de penicilina en sangre están por debajo de la concentración mínima inhibitoria
b) que se necesita una concentración de penicilina >0.03 µg/ml de penicilina para asegurar un efecto bactericida 
y c) que para curar una sífilis precoz se requiere una concentración adecuada mantenida durante 7 días. Durante muchos años se ha tenido a la penicilina benzatina como el tratamiento de elección, excepto en el caso de una invasión del LCR (se han aislado treponemas en LCR de pacientes con chancro primario, lo que refleja la espiroquetorraquia). Por lo tanto, el tratamiento actual de la sífilis con una combinación antibiótica o un régimen prolongado asegura que esta secuela, la más importante de la sífilis, no ocurrirá. Esto es especialmente importante en los pacientes inmunodeprimidos. 

Sífilis temprana (primaria, secundaria) 
● Penicilina G benzatina 2.400.000 UI intramuscular por semana en 3 dosis. 
● Doxiciclina, 100 mg oral, 21 d. 
● Otros: amoxicilina + probenecid, ceftriaxona, penicilina G procaína + probenecid. 
● En los alérgicos a la penicilina: doxiciclina o eritromicina. Sífilis tardía y neurosífilis 
● Penicilina G sódica . 
● Otros: amoxicilina + probenecid, doxiciclina, ceftriaxona y penicilina G procaína + probenecid. En los alérgicos a la penicilina se recomienda la desensibilización y el tratamiento con penicilina y, como alternativa, el cloranfenicol. 

Sífilis en el embarazo: Las gestantes deberían recibir tratamiento adecuado al estadio de la sífilis. Es de elección la penicilina, incluso en los alérgicos, donde es necesaria la desensibilización, porque tanto las tetraciclinas como el cloranfenicol no se recomiendan explícitamente. Sífilis congénita Se recomienda efectuar el tratamiento en aquellos niños nacidos de madres no tratadas correctamente, y es de elección la penicilina G sódica o la penicilina G procaína. 

Sífilis en los inmunodeprimidos: Estos pacientes deben ser tratados siguiendo el mismo esquema que para la neurosífilis. Infección persistente Hay pacientes en los que, a pesar de un tratamiento adecuado, las pruebas reagínicas no llegan a negativizarse. Al parecer, se debe a que en estos pacientes quedan treponemas en lugares en los que se alcanzan con dificultad niveles adecuados de antibiótico: cámara anterior del ojo, LCR, laberinto, etc. 

Seguimiento del tratamiento: En todos los pacientes con sífilis precoz y congénita hay que repetir las pruebas no treponémicas cuantitativas (RPR o VDRL) al cabo de uno, tres, seis y 12 meses del tratamiento de la sífilis. En los pacientes infectados por el VIH, además de estos controles, se efectuarán otros adicionales en el segundo y noveno mes después del tratamiento